Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms