Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPN12Q6ZSI9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms