Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDE2Q6IQ49 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms