Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms