Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC27A3Q5K4L6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A3Q5K4L6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms