Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms