Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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