Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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CALCOCO2Q13137 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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CALCOCO2Q13137 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CALCOCO2Q13137 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CALCOCO2Q13137 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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CALCOCO2Q13137 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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