Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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