Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC173Q0VFZ6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms