Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DHX9Q08211 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms