Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms