Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLTPP55058 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLTPP55058 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLTPP55058 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.3 ms