Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHI3L1P36222 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms