Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb3P28231 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb3P28231 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb3P28231 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb3P28231 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb3P28231 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb3P28231 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gjb3P28231 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms