Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRPH2P23942 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms