Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCSHP23434 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCSHP23434 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCSHP23434 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCSHP23434 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GCSHP23434 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCSHP23434 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSHP23434 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSHP23434 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSHP23434 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSHP23434 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSHP23434 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSHP23434 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSHP23434 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSHP23434 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms