Protein–RNA interactions for Protein: P23280

CA6, Carbonic anhydrase 6, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA6P23280 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA6P23280 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA6P23280 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA6P23280 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA6P23280 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA6P23280 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA6P23280 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA6P23280 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA6P23280 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA6P23280 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA6P23280 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA6P23280 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA6P23280 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA6P23280 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA6P23280 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA6P23280 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA6P23280 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms