Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms