Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC9A1P19634 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC9A1P19634 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms