Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGAM1P18669 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGAM1P18669 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGAM1P18669 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGAM1P18669 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGAM1P18669 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PGAM1P18669 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PGAM1P18669 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PGAM1P18669 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGAM1P18669 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGAM1P18669 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms