Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL6A2P12110 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms