Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF1P09603 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF1P09603 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms