Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms