Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms