Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF5Q9Y2D1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms