Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNNQ9UQP3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNQ9UQP3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms