Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP21Q9UK80 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms