Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00474Q9P2X8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms