Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms