Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NYXQ9GZU5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms