Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms