Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC107Q8WV48 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms