Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD26

CHD6, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 6, humanhuman

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Length 2,715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD6Q8TD26 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD6Q8TD26 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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