Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CSNK2A3Q8NEV1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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