Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CMTM1Q8IZ96 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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