Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms