Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CEP170Q5SW79 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP170Q5SW79 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms