Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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