Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FSCN1Q16658 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms