Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms