Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPARCL1Q14515 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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