Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB3Q13509 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms