Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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FOXE3Q13461 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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FOXE3Q13461 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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FOXE3Q13461 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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FOXE3Q13461 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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FOXE3Q13461 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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