Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GRIN2BQ13224 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms