Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALCOCO2Q13137 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO2Q13137 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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