Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPS1Q13098 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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