Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms