Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms