Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMD4P55036 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms